这篇文章主要介绍ITK-SNAP实现抠图操作并保存mask的方法，文中示例代码介绍的非常详细，具有一定的参考价值，感兴趣的小伙伴们一定要看完！

问题描述：

想要去掉图像背景,只保留中心部分

目标：

1.利用ITK-SNAP制作二值化标签(即mask)

2.利用软件ITK-SNAP把一幅图像中自己想要的部分抠出来

步骤:

1.保存mask

打开ITK-SNAP ,这是一款可以方便进行勾画操作,制作标签的软件

1.点击勾画按钮

2.在图像中选点进行勾画

3.勾画完成后点击accept,可以看到所勾画的区域被标签颜色所覆盖

4.滚动鼠标滚轮到下一层(对于3D图像),继续勾画

tips:点击"paste last polygon"按钮使用上一层的勾画结果,拖动勾画框可以进行修改

5.勾画完成后按ctrl+S保存图像,此时所保存的即为二值化的mask(标签)


2.提取目标区域（抠图）

思想：将保存的二值化mask与原图像做点乘，就可以将去除无关背景，得到中心区域的目标图像

方法：（对于nii格式的图像）

import nibabel as nibimport numpy as npindex = list(['1','14','4','5','7','70','148'])#一共7张待处理图像for i in range (len(index)): #图像位置 nii_file = '/home/YinXiaolong/1909/MRBrainS18_data/training_corrected_selected/'+index[i]+'/data/reg_IR.nii.gz' nii_file2 = '/home/YinXiaolong/1910/mask_multiple/mask/' +'mask'+ index[i]+ '.nii.gz' #载入图像 img = nib.load(nii_file).get_fdata() img2 = nib.load(nii_file2).get_fdata() #两幅图像相乘 img3 = np.multiply(img,img2) #将矩阵转换为nii array_img = nib.Nifti1Image(img3,None) #保存并导出 nib.save(array_img, 'reg_IR'+'_'+index[i]+'.nii') print('img'+index[i]+'Done')

对于一般格式图像利用numpy中的img = np.multiply(img1,img2)进行两幅图像的点乘即可。

以上是ITK-SNAP实现抠图操作并保存mask的方法的所有内容，感谢各位的阅读！希望分享的内容对大家有帮助，更多相关知识，欢迎关注亿速云行业资讯频道！